El templo de San Francisco en Ayamonte fue construido en el siglo XVI sobre un antiguo convento franciscano que fue levantado un siglo antes. Aquí se guardó la reliquia del Santo Sudario.
El terremoto que asoló Ayamonte en 1755 lo dañó bastante a este templo en Ayamonte, pero fue reconstruido con un estilo mudejar. Destacan sus pinturas y sus frescos.
Desde 1935 es Monumento Histórico Artístico.
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